Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApobrQ8VBT6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms