Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp4Q8R2N2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms