Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hecw1Q8K4P8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms