Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem17Q8K0U3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms