Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra5Q8BHJ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra5Q8BHJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra5Q8BHJ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra5Q8BHJ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms