Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl42Q8BFQ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms