Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll4Q80V24 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms