Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnkQ7TSL0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnkQ7TSL0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms