Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms