Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bnip1Q6QD59 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms