Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms