Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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