Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc36Q6PDM4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc36Q6PDM4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc36Q6PDM4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc36Q6PDM4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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