Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhb9Q6PB60 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhb9Q6PB60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms