Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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