Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt72Q6IME9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt72Q6IME9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms