Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Top2bQ64511 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms