Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim24Q64127 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim24Q64127 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms