Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms