Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms