Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sptbn1Q62261 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptbn1Q62261 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sptbn1Q62261 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sptbn1Q62261 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sptbn1Q62261 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sptbn1Q62261 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sptbn1Q62261 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptbn1Q62261 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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