Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms