Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkilQ60665 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkilQ60665 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkilQ60665 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkilQ60665 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkilQ60665 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms