Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms