Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms