Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Herc2Q4U2R1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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