Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms