Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc185Q3V118 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc185Q3V118 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc185Q3V118 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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