Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed1Q3V009 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms