Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SvipQ3UZP4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SvipQ3UZP4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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