Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1lQ3USQ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms