Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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