Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms