Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms