Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc34Q3UI66 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms