Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms