Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd4Q3TT99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms