Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ptchd1Q14B62 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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