Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms