Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms