Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms