Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox9Q04887 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms