Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms