Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms