Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms