Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crmp1P97427 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crmp1P97427 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms