Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1bP70700 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms