Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms