Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan5P62080 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan5P62080 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms