Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hps5P59438 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hps5P59438 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hps5P59438 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms